محاسبه‌ی نهایی مالیات بر ارزش افزوده در قالب اظهارنامه‌ی دوره‌ای (معمولاً فصلی) به سازمان امور مالیاتی ارائه می‌شود.
| مرحله | کار حسابدار |
|---|---|
| ثبت سند حسابداری | ثبت جداگانه‌ی مالیات خرید و مالیات فروش در حساب‌های مربوطه |
| تنظیم اظهارنامه | محاسبه‌ی مابه‌التفاوت مالیات فروش و مالیات خرید همان دوره |
| پرداخت یا استرداد | پرداخت مابه‌التفاوت مثبت، یا درخواست استرداد در صورت مانده‌ی بستانکار |
در صورت اعتراض به مبلغ تشخیصی سازمان، مودی می‌تواند دفاعیات خود را ارائه و درخواست استرداد یا اصلاح را پیگیری کند.
مثال: شرکتی که در یک فصل صادرات داشته و مالیات فروشِ آن معاف است، معمولاً مانده‌ی بستانکار پیدا می‌کند و می‌تواند درخواست استرداد مالیات خریدِ خود را ثبت کند.