کاربردِ حسابرسیِ عملیاتی بسته به بخشِ دولتی یا خصوصی، تفاوت‌هایِ ظریفی دارد:
| بُعد | بخشِ دولتی | بخشِ خصوصی |
|---|---|---|
| محرکِ اصلی | پاسخگویی به مردم و مراجعِ نظارتی | افزایشِ سودآوری و مزیتِ رقابتی |
| تمرکزِ معیار | رعایتِ بودجه و قوانینِ مصوب | کاهشِ هزینه و افزایشِ کارایی |
| ذی‌نفعانِ گزارش | مجلس، دیوانِ محاسبات، عمومِ مردم | هیئت‌مدیره و مدیرانِ ارشد |
در هر دو بخش، مدیران معمولاً حسابرسیِ عملیاتی را برایِ یکی از این دلایل درخواست می‌کنند: کشفِ عللِ افتِ عملکرد، آماده‌سازی برایِ تصمیم‌گیریِ استراتژیک، یا اطمینان از رعایتِ کنترل‌هایِ داخلی. یافته‌هایِ حسابرس همواره با معیارِ ازپیش‌تعیین‌شده سنجیده می‌شوند تا نتیجه عینی و قابلِ دفاع باشد.
مثال: در یک اداره‌یِ دولتی، حسابرسیِ عملیاتی ممکن است نشان دهد که فرآیندِ صدورِ مجوز به‌جایِ ۱۰ روزِ مصوب، ۲۵ روز طول می‌کشد؛ در یک شرکتِ خصوصی، همین نوع حسابرسی ممکن است اتلافِ موادِ اولیه در خطِ تولید را آشکار کند.